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Instalar Drupal com Composer não é apenas a forma mais comum de baixar o core. É escolher uma maneira previsível de atualizar dependências, repetir o ambiente e colaborar com outras pessoas.
Comece pelo projeto recomendado
composer create-project drupal/recommended-project meu-site
cd meu-site
composer require drush/drush
O template recomendado mantém o webroot separado do código do projeto e deixa mais claro onde vivem temas e módulos customizados.
O que deve entrar no Git
Versione código próprio, composer.json, composer.lock, configurações exportadas e documentação. Não versione segredos, arquivos enviados ou ajustes específicos da máquina local.
Antes de instalar o primeiro módulo, documente como iniciar o ambiente e como validar o projeto. Parece detalhe no primeiro dia, mas evita que uma atualização futura vire arqueologia.